Тя е построена в 1926 година по проект на архитект Коста Николов, който е ръководел и строежа. Църквата е построена на мястото на старата камбанария и пристройка към църквата "Св. Пантелеймон". Тази постройка е била използвана за храм "Св. Никола" (1799 година). Днес църквата "Св. Николай" се намира в комплекса от сгради: църквата "Св. Пантелеймон" (1634 година), палатата на Видинската митрополия (1924 година), мавзолеят на Антим I (1934 година) и епархийското училище (1926 година). Тя е от типа трикорабни кръстокуполни църкви, с една апсида, притвор и кули. Освен задна галерия за хора, в нея има и две странични галерии. Стените са изцяло изографисани.